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Salmonella, secteur agroalimentaire - T1 2010 : de janvier à mars 2010

Programme intégré canadien de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (PICRA)

Préambule

  1. Les données du présent rapport ont été extraites du système DEXA du PICRA, le 9 juin 2010. Toutes les données sont provisoires. Certaines valeurs pourraient être différentes dans les prochains rapports en raison des nouvelles données qui seront générées.
  2. Les données présentées dans ce rapport ont été obtenues dans le cadre des composantes suivantes du programme de surveillance PICRA :

    Surveillance en abattoir

    La surveillance en abattoir prévoit le prélèvement d’échantillons de contenu caecal auprès de poulets, de porcs et de bovins de boucherie sains dans tout le Canada.

    Surveillance de la viande vendue au détail

    La surveillance de la viande vendue au détail prévoit le prélèvement d’échantillons de viande de poulet et de porc dans des magasins de vente au détail, en Colombie-Britannique, en Saskatchewan, en Ontario, au Québec et dans les provinces Maritimes.

    Diagnostics/Cas cliniques


    La surveillance des cas cliniques consiste en une surveillance passive des isolats de Salmonella provenant des laboratoires régionaux ou provinciaux de santé animale au Canada. Il s'agit d’isolats qui sont soumis au Laboratoire de lutte contre les zoonoses d’origine alimentaire (LLZOA) pour une caractérisation plus poussée.

    Surveillance à la ferme

    La surveillance à la ferme fait appel à des fermes sentinelles situées en Alberta, en Saskatchewan, en Ontario et au Québec, où sont prélevés des échantillons composites de matière fécale provenant des porcs.

    Recherche et surveillance

    La composante recherche et surveillance porte sur les isolats de Salmonella qui ont été soumis au LLZOA pour une caractérisation plus poussée. Ces isolats ont été prélevés dans le cadre de projets de recherche précis réalisés dans différentes universités et agences gouvernementales, au Canada, ainsi que dans le cadre de programmes de monitoring gouvernementaux. Ces isolats peuvent provenir d'échantillons prélevés auprès d’animaux, dans l’environnement ou dans les produits et ingrédients destinés à l’alimentation animale.
  3. Les sérotypes mentionnés sont ceux qui ont été observés au cours du trimestre visé UNIQUEMENT. Prière de consulter les résumés trimestriels antérieurs pour les dénombrements de sérotypes qui n’ont pas été isolés au cours du trimestre visé.
  4. La valeur « prévue » (Prév) correspond à la valeur médiane par trimestre (basé sur la totalité des données de l’ensemble des années antérieures et à l’exclusion des données de l’année en cours). Les années de référence utilisées pour calculer ces valeurs seront mises à jour à mesure que de nouvelles composantes seront ajoutées ou si des modifications sont apportées aux composantes de surveillance existantes.
    1. Les valeurs médianes des ventes au détail sont uniquement basées sur les données 2007-2009, parce que certaines provinces ont été ajoutées en 2005 (Sask.) et 2006 (C.- B.).
    2. Lorsque la valeur prévue est égale à 0, c'est que le sérotype correspondant n’a pas été observé précédemment au cours du trimestre visé, pour une combinaison espèce/composante donnée.
    3. Lorsqu’il n'y a aucune valeur prévue au tableau (= ’.’), c’est que le sérotype correspondant n’a pas été observé auparavant pour cette espèce pour une composante donnée
    4. Aucune valeur prévue n’est fournie pour la recherche et la surveillance, étant donné que ces chiffres varient d'un mois à l'autre.
  5. Cases ombrées :
    1. Signification des cases jaunes :
      1. Le nombre d'isolats observés au cours d'un trimestre est plus élevé que le 75e percentile en fonction des valeurs de toutes les années antérieures complètes.
    2. Signification des cases rouges :
      1. Le nombre d'isolats observés est plus élevé que ce qui n’a jamais été signalé au cours de TOUT trimestre antérieur, pour ce sérotype d’une combinaison composante/espèce donnée.
      2. Un nouveau sérotype est identifié dans une combinaison espèce/composante donnée où il n'avait PAS été détecté auparavant.
  6. Le tableau 1 présente les sérotypes que l’on prévoyait observer, mais qui n’ont PAS été détectés au cours du trimestre visé (c.-à-d. >1 isolat prévu par trimestre pour chaque combinaison espèce/ composante).
  7. Combinaison particulière : Dans chaque rapport trimestriel, nous présentons des résultats d'isolats pour une association particulière composante /espèce. Ces associations particulières sont choisies, soit parce que le nombre de ces isolats semble avoir augmenté ou parce qu’elles représentent un intérêt pour les lecteurs. Pour toute suggestion à ce sujet, communiquer avec le PICRA à l’adresse suivante : cipars-picra@phac-aspc.gc.ca.
    1. Pour le premier trimestre de 2010, nous présentons les isolats de Salmonella observés chez des reptiles (tableau 2).
  8. Pour des questions sur les informations présentées dans ce rapport ou pour des suggestions concernant le rapport ou la rubrique sur la combinaison particulière, n’hésitez pas à communiquer avec nous à l’adresse suivante : cipars-picra@phac-aspc.gc.ca.
Tableau 1. Sérotypes que l’on prévoyait observer, mais qui n’ont pas été détectés au cours du trimestre visé (par association espèce/composante).
Composante* Porcs Poulets Autres
Abattoir Bovismorbificans Kiambu  
Vente au détail   Infantis  
Diagnostics/Cas cliniques Senftenberg   Newport
Ferme BrandenburgTyphimurium    

* Des informations plus détaillées sur les composantes de la surveillance sont fournies au point 2 du Préambule.

 

Tableau 2. Isolats de Salmonella provenant de reptiles.
Sérotype 2010 2009
T1 T1 T2 T3 T4
Obs Prév Obs Prév Obs Prév Obs Prév Obs Prév
Diagnostics / Cas cliniques*
Enteritidis 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0
Fluntern 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1
IIIa 41:-:- 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
IIIb 17:-:e,n,x,z15 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
IV 43:z4,z23:- 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0
Total Salmonella 5 3 1 4 3 3.5 1 3.5 2 5

* Des informations plus détaillées sur les composantes de la surveillance sont fournies au point 2 du Préambule.

Tableau 3. Isolats de Salmonella provenant d'échantillons de porc.
Sérotype 2010 2009
T1 T1 T2 T3 T4
Obs Prév Obs Prév Obs Prév Obs Prév Obs Prév
Abattoir*
Agona 1 2 1 3 0 2 0 2 1 1
Brandenburg 1 4 4 3 4 2 3 4 2 3
Cerro 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
Derby 11 11 6 11.5 8 11 5 12.5 7 11
Give 2 1 1 1 2 2 1 1 0 1.5
Heidelberg 2 1 0 1 0 2 0 2 0 2.5
I 4,[5],12:i:- 1 1.5 0 1.5 0 1 1 1 0 1.5
Infantis 3 3.5 4 3 3 5 2 3 2 2.5
London 2 1 0 1 0 3 0 1 1 4
Muenster 1 3 0 3 1 0 0 0 0 0
Orion 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1
Schwarzengrund 3 2 2 2 0 3 0 3 3 2
Typhimurium 7 4 1 4 3 4.5 3 6 4 4
Typhimurium var. 5- 10 3 3 3.5 7 7 4 6.5 6 3.5
Worthington 6 1 1 1.5 4 2 1 1 2 2
Total Salmonella 52 43 40 44.5 35 44 37 55.5 35 41
Vente au détail*
Brandenburg 1 2 2 . 0 . 0 . 1 .
Enteritidis 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0
Pending 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
Total Salmonella 3 6 9 4.5 4 4 4 5 1 4
Diagnostics / Cas cliniques*
Agona 1 1 0 1 0 1 0 2 1 2
Anatum 1 1 0 1 0 1 0 1 0 1
Brandenburg 1 1 2 1 3 2 2 1.5 1 2
California 1 1 0 1 0 1 1 0 1 1
Derby 5 6 8 5 7 4 6 5 6 4.5
Give 1 0 0 0 0 1 1 1 1 1
Hartford 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
Heidelberg 1 2 1 3 0 2 0 1 0 1
I 4,[5],12:i:- 5 2 1 2 3 1 1 2 2 1
I 6,7:-:l,w 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0
I 6,8:r:- 2 0 0 . 0 . 0 . 2 .
Infantis 4 2 5 2 2 2 4 2 1 4
Livingstone 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1
Mbandaka 3 1 1 1 3 1 1 2 2 1
Montevideo 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
Newport 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
Schwarzengrund 2 2.5 0 2.5 3 1 2 2 3 1
Tennessee 1 2 0 2 0 2 0 1 0 1
Typhimurium 16 15 15 17 22 13.5 16 19.5 18 19
Typhimurium var. 5- 4 9 9 9.5 8 7 3 10.5 7 11
Total Salmonella 53 49 59 44.5 62 41 41 48.5 64 50.5
Ferme*
Derby 6 3.5 4 3 1 2 9 4 11 7
Infantis 4 2 1 2 3 1 2 2 1 2
Mbandaka 1 2 1 3 0 3 1 1 0 1
Typhimurium var. 5- 7 8 8 9 3 5 3 6 14 6
Total Salmonella 18 21 27 15 17 20 25 28 61 29
Recherche et surveillance*
Alachua 1   0   0   0   0  
I 4,[5],12:i:- 1   2   0   1   0  
I 8,20:-:- 1   0   0   0   0  
Krefeld 1   0   0   0   0  
Typhimurium var. 5- 2   7   2   0   0  
Uganda 1   0   0   0   0  
Total Salmonella 7   10   7   1   2  

* Des informations plus détaillées sur les composantes de la surveillance sont fournies au point 2 du Préambule.

Tableau 4. Isolats de Salmonella provenant d'échantillons de poulet.
Sérotype 2010 2009
T1 T1 T2 T3 T4
Obs Prév Obs Prév Obs Prév Obs Prév Obs Prév
Abattoir*
Cubana 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0
Enteritidis 5 4 12 3 5 3 17 5 10 5
Hadar 1 3 3 2.5 1 2.5 3 4 2 3
Heidelberg 10 9 8 9.5 10 9 21 11.5 11 14
I 6,8:-:e,n,x 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0
I Rough:i:z6 1 0 0 0 0 2 1 1 1 1
Indiana 1 0 0 0 0 0 0 1.5 0 0
Kentucky 9 23 41 15 19 14 19 14 16 18
Schwarzengrund 1 2 0 2 0 1 0 1.5 1 1
Senftenberg 1 1.5 1 2 0 1 0 0 0 1
Total Salmonella 31 56 73 49 39 35.5 71 42.5 47 51.5
Vente au détail*
Agona 1 2 1 3 0 1.5 2 1 0 1
Albany 3 2 2 2 0 0 0 0 0 0
Anatum 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
Braenderup 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1
Enteritidis 23 15 24 10.5 21 7 26 12.5 23 9.5
Hadar 6 6 6 7 4 2.5 12 6 5 6.5
Heidelberg 28 30 39 24 28 15 45 18.5 41 26.5
I 4,[5],12:i:- 1 2 1 2 0 1 3 2 1 3
I 6,8:-:e,n,x 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
I 8,20:i:- 1 1 1 0 1 1 1 0 3 0
Indiana 1 1 0 1 0 1 0 0 0 2
Kentucky 19 38 44 31.5 23 29 32 30.5 24 24.5
Kiambu 3 2 1 4 1 3 1 2.5 0 3.5
Litchfield 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
Mbandaka 2 1.5 1 2 0 2 0 1 0 1
Ohio 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
Schwarzengrund 4 2 2 1.5 1 3 5 1.5 2 3
Thompson 1 4.5 0 4.5 1 6.5 3 4 4 1.5
Typhimurium 1 2 8 1.5 0 3 2 3.5 1 2
Typhimurium var. 5- 2 2 0 2 1 2 0 1 0 2
Worthington 1 4 4 . 1 . 0 . 1 .
Pending 7 . 0 . 1 . 0 . 0 .
Total Salmonella 109 116 139 104 87 82.5 136 91 112 90
Diagnostics / Cas cliniques*
Agona 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0
Enteritidis 38 29 36 22 24 9 27 7 50 9
Hadar 2 3.5 0 3.5 3 1 0 1 0 1.5
Heidelberg 21 6 17 6 15 6.5 5 5.5 4 5
I 40:b:- 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
I 6,7:-:- 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
I 6,8:-:e,n,x 1 0 0 0 0 0 0 2 0 0
I Rough:i:z6 1 0 0 . 0 . 0 . 0 .
Indiana 1 1 1 . 0 . 0 . 1 .
Kentucky 37 9 7 10 8 2 11 3 14 1
Senftenberg 1 1.5 2 1 1 2 0 1 0 1.5
Thompson 2 1 0 1 0 1 0 2 0 1
Typhimurium 2 2 2 2 2 2 9 1 1 1
Worthington 1 0 0 . 0 . 0 . 0 .
Total Salmonella 110 33 68 23 62 18 68 23.5 75 17.5
Recherche et surveillance*
Agona 2   0   0   0   0  
Alachua 1   0   0   1   1  
Braenderup 2   3   4   3   2  
Bredeney 1   0   0   0   0  
Enteritidis 49   93   46   63   66  
Hadar 7   2   4   2   1  
Heidelberg 74   45   90   69   57  
I 19:-:e,n,z15 1   0   0   0   0  
I 4,[5],12:i:- 2   11   6   2   10  
I 4,[5],12:r:- 4   0   0   0   1  
I 6,7:-:1,5 1   0   0   1   0  
I 8,20:-:z6 2   1   2   6   2  
I Rough:g,m:- 1   1   5   6   2  
I Rough:i:1,2 1   0   1   0   0  
I Rough:i:z6 1   0   0   5   1  
I Rough:r:1,2 2   4   2   2   8  
I Rough:z10:e,n,z15 1   0   1   0   1  
IIIa 23:g,z51:- 2   0   0   1   0  
Infantis 13   6   5   7   5  
Kentucky 140   77   102   93   88  
Mbandaka 3   13   19   11   30  
Montevideo 1   4   3   9   5  
Rissen 1   9   1   7   0  
Saintpaul 3   0   0   0   0  
Schwarzengrund 13   0   7   27   2  
Senftenberg 3   10   7   1   3  
Thompson 15   1   2   3   5  
Typhimurium 15   8   14   36   4  
Typhimurium var. 5- 3   1   2   0   2  
Worthington 2   1   2   5   0  
Total Salmonella 366   306   359   401   299  

* Des informations plus détaillées sur les composantes de la surveillance sont fournies au point 2 du Préambule.

 

Tableau 5. Isolats de Salmonella provenant d’autres espèces animales (à l'exception des porcs et des poulets).
Sérotype 2010 2009
T1 T1 T2 T3 T4
Obs Prév Obs Prév Obs Prév Obs Prév Obs Prév
Diagnostics / Cas cliniques*
Agona 5 3 0 3 1 1 1 2 4 2
Enteritidis 16 9 10 6.5 10 2.5 8 2 16 2.5
Fluntern 1 1 0 1 0 0 0 0 0 1
Hadar 2 2 0 2 6 2 3 2.5 2 3
Heidelberg 10 7 3 11 7 16 6 26.5 10 13
I 4,[5],12:i:- 5 2 1 3 1 3 3 2 0 2
I 6,14,18:-:- 2 3.5 2 4 1 2.5 1 2 1 2
I Rough:k:- 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
IIIa 41:-:- 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
IIIb 17:-:e,n,x,z15 1 . 0 . 0 . 0 . 0 .
IIIb 61:-:1,5,7 1 1 0 1 0 0 1 0 0 0
IV 43:z4,z23:- 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0
Infantis 3 1.5 0 1.5 0 2 1 2 1 2.5
Kentucky 10 3 2 4 1 4 4 6.5 2 7.5
Rissen 2 1 0 1 1 3 0 0 0 1
Schwarzengrund 2 1.5 23 1 2 1 7 2 0 1
Senftenberg 4 2 1 2 2 4 2 2 3 2
Thompson 1 2 0 2 0 3 3 3 1 2.5
Typhimurium 11 21 24 20 10 14.5 16 23.5 17 18
Typhimurium var. 5- 13 4 4 6.5 28 8.5 25 13.5 4 7
Worthington 1 1 1 1 0 1 1 1 3 0
Total Salmonella 93 94 92 97 84 80.5 103 123 76 87.5
Recherche et surveillance*
Agona 2   2   1   4   1  
Alachua 2   1   0   0   2  
Albany 2   0   0   2   0  
Braenderup 1   4   0   2   2  
Enteritidis 17   12   24   25   6  
Give 2   3   0   1   6  
Hadar 47   0   7   5   3  
Heidelberg 22   18   19   28   3  
I 10:-:1,5 2   0   0   0   0  
I 10:e,h:- 3   1   0   3   0  
I 4,12:-:1,5 1   0   0   0   0  
I 4,[5],12:-:- 2   2   0   0   0  
I 4,[5],12:-:1,2 1   2   1   0   0  
I 4,[5],12:e,h:- 1   0   0   0   0  
I Rough:d:1,7 1   0   0   6   0  
I Rough:e,h:1,2 3   0   0   0   0  
I Rough:e,h:1,5 1   1   0   0   0  
I Rough:i:- 3   0   0   0   0  
I Rough:r:1,2 7   0   0   0   1  
I Rough:z4,z23:- 1   0   0   0   0  
IIIb 60:r:z35 1   0   0   0   0  
Johannesburg 1   0   0   0   1  
Kentucky 18   17   9   11   7  
Mbandaka 7   0   3   2   3  
Montevideo 1   1   0   3   0  
Muenster 1   1   3   3   0  
Newport 1   0   0   6   0  
Ohio 1   0   0   0   0  
Orion 8   8   3   2   8  
Pomona 1   0   0   0   0  
Saintpaul 13   8   10   0   3  
Schwarzengrund 19   5   6   8   14  
Senftenberg 7   24   13   11   6  
Thompson 4   0   0   0   0  
Tumodi 2   0   0   0   0  
Typhimurium 3   11   6   7   8  
Typhimurium var. 5- 10   6   1   15   2  
Total Salmonella 219   162   160   261   108  

* Des informations plus détaillées sur les composantes de la surveillance sont fournies au point 2 du Préambule.

 

Tableau 5a. Sérotypes de Salmonella excédant le 75e percentile, par espèce : 1er trimestre 2010.
Sérotype Espèce
Agona Dinde (n=3) Canine (n=2)
Enteritidis Aviaire (n=8)
Féline (n=2)
Bovine (n=1)
Canard (n=1)
Équine (n=1)
Reptile (n=1)
Environnement (n=2)
I 4,5,12:i:- Bovine (n=5)  
I: Rough-:k:- Environnement (n=1)  
IIIa 41-:-: Reptile (n=1)  
IIIb:17:-:e,n,x,z15 Reptile (n=1)  
IV 43:z4,z23:- Reptile (n=1)  
Senftenberg Dinde (n=3) Aviaire (n=1)
Typhimurium var 5- Bovine (n=8)
Dinde (n=2)
Aviaire (n=3)

*Des informations plus détaillées sur les composantes de la surveillance sont fournies au point 2 du Préambule.